Dünyaca ünlü İspanyol yönetmen Alejandro Amenábar’ın imzasını taşıyan film, ilk kadın matematikçi Hypatia’nın trajik hayatını anlatıyor. İskenderiye, 391… Güzel Hypatia öğrencilerine astronomi, matematik ve felsefe öğretmektedir. Zaman zaman çatışmalar çıksa da şehirde Hıristiyanlar ile Yahudiler arasında çok hassas dengeler üzerinde kurulu bir barış hüküm sürmektedir. Cyril’in (Sami Samir) liderliğindeki Hıristiyanlar, Yahudileri ve tüm kadınları, dinlerine karşı düşman olarak görmektedir. Hypatia, durumun iyiye gitmediğini ve kendini kötü bir kaderin beklediğini görse de bilim için çalışmaya ve doğru bildiği yolda gitmeye devam eder.